Regionalny Dyrektor Ochrony Środowiska we Wrocławiu wydał zarządzenia w sprawie ustanowienia planów zadań ochronnych dla dwóch kolejnych obszarów Natura 2000 - Kopalnie w Złotym Stoku i Skałki Stoleckie.

Obszar mający znaczenie dla Wspólnoty Kopalnie w Złotym Stoku wyznaczono w celu zachowania we właściwym stanie ochrony stanowisk występujących w nim nietoperzy, wymienionych w Załączniku II Dyrektywy Rady 92/43/EWG a także siedlisk przyrodniczych, wymienionych w Załączniku I Dyrektywy Rady 92/43/EWG. Obszar stanowi ważne zimowisko dla ok. 130 osobników nietoperzy i odgrywa kluczową rolę w ochronie nietoperzy w tej części Polski. Sztolnie w Złotym Stoku są miejscem występowania łącznie 11 gatunków nietoperzy, w tym nocka orzęsionego, podkowca małego i nocka dużego. Poza okresem zimowym sztolnie wykorzystywane są jako miejsca godowe mopka. Znaczna część obszaru jest zajęta przez cenne siedliska, z czego wyróżnić można duże płaty kwaśnych buczyn, dobrze wykształcone żyzne buczyny oraz ściany skalne i urwiska krzemianowe ze zbiorowiskami z Androsacion vandelii.

Obszar mający znaczenie dla Wspólnoty Skałki Stoleckie wyznaczono w celu zachowania we właściwym stanie ochrony stanowiska występujących w nim nietoperzy z gatunku mopek, wymienionego w Załączniku II Dyrektywy Rady 92/43/EWG.

W wyniku prac inwentaryzacyjnych w maju 2013 r. do listy przedmiotów ochrony dodano dwa regularnie pojawiające się w obszarze gatunki - nocka Bechsteina i nocka dużego.

Sztolnia w Skałkach Stoleckich jest jednym z najcenniejszych zimowisk dla ok. 354 osobników z 12 gatunków nietoperzy w południowo-zachodniej Polsce. Jest to jedno z największych zimowisk mopka, gacka brunatnego i nocna Natterera w regionie. Ponadto w okresie rojenia sztolnia odwiedzana jest przez osobniki z 9 gatunków - najliczniejsze są mopki, nocki Natterera i gacki brunatne, których rojące populacje szacuje się na co najmniej kilkaset osobników. Obszar w większości pokrywa się z rezerwatem przyrody Skałki Stoleckie.