Kanały burzowe charakteryzuje specyficzny mikroklimat. Temperatura w nich jest stała, a wilgotność powietrza wysoka. Takie warunki odpowiadają nietoperzom, szczególnie zimą, kiedy bez względu na sytuację atmosferyczną, zapewniają hibernującym zwierzętom komfort termiczny.

Olsztyński kanał, o długości około 700 m, stanowi ważne i kluczowe w skali kraju zimowisko nietoperzy. Najliczniej występują tu: nocek Natterera, nocek rudy oraz gacek brunatny. Po raz kolejny potwierdzono występowanie mopka, gatunku znajdującego się na Czerwonej Liście Zwierząt Ginących i Zagrożonych w Polsce oraz zamieszczonego w załączniku II i IV Dyrektywy Rady EWG w sprawie ochrony siedlisk naturalnych oraz dzikiej fauny i flory (tzw. Dyrektywy Siedliskowej). Wymieniony jest także w załączniku II Konwencji Berneńskiej o ochronie gatunków dzikiej flory i fauny europejskiej oraz ich siedlisk. Mopek został również zaliczony przez Międzynarodową Unię Ochrony Przyrody (IUCN) do gatunków zagrożonych wyginięciem (kategoria VU).

Ten niewielki odcinek kanału stanowi jedno z najliczniejszych, stwierdzonych zimowisk w Polsce i zarazem największe na terenie Warmii i Mazur.

Największym zagrożeniem dla zimujących nietoperzy jest przede wszystkim obecność człowieka. Hibernujący ssak znacznie obniża temperaturę ciała, a tempo procesów życiowych spada wielokrotnie. W okresie zimowego snu korzysta jedynie z podskórnych zapasów tłuszczu, zgromadzonych podczas jesiennego żerowania. Przebudzony i spłoszony nietoperz musi podnieść temperaturę ciała o kilka stopni, co jest bardzo dużym wydatkiem energetycznym. Jeśli wielokrotne przebudzenia spowodują wyczerpanie się zapasów tłuszczu przed nastaniem wiosny, kończy się to śmiercią zwierzęcia.

W Polsce wszystkie gatunki nietoperzy są objęte całoroczną, ścisłą ochroną gatunkową. W stosunku do gatunków chronionych zakazuje się między innymi ich płoszenia, przetrzymywania, zabijania oraz niszczenia ich siedlisk i kryjówek. Złamanie zakazów skutkuje odpowiedzialnością karną.

W celu zachowania tej unikatowej, w skali kraju i województwa, zimowej kryjówki nietoperzy Regionalny Dyrektor Ochrony Środowiska w Olsztynie podejmuje działania zmierzające do objęcia tego miejsca jedną z form ochrony przyrody.